It should refer an ´organ´ başbakan and başkent do not refer an organ. When it comes to "başparmak " that must be exception I believe.

The rule for that exception is that ;

The adjective compounds that are formed with "baş " are written as One word ;

a.  başparmak

başağırlık,

başbakan,

başbayan,

başçavuş

başeser,

başfiyat

başhekim,

başhemşire

başkahraman

başkent

başkomutan

başköşe

başmüfettiş

başöğretmen

baş­parmak

başpehlivan

başrol

başsavcı

başyazar .

The thumb is the boss of the fingers.

6. The vowel or the wide vowel of the suffix that comes before "-a / -e, -acak / -ecek, -ayım / -eyim, -alım / -elim, -an / -en " suffixes  is written with  a / e  regardless of  their verbal ways.

written way                      Possible Verbal way

başlaya                                      başlıya

başlayacağım                          başlıyacağım

geleyim                                     geliyim

gelmeyelim                             gelmiyelim

başlayan                                  başlıyan

gelmeyen                               gelmiyen

7. The locative suffix   -da / -de / -ta / -te   is always written attached to word.

devede  kulak

yolda  kalmak

ayakta  durmak

işte  çalışmak

Yurtta sulh, cihanda sulh. (Atatürk)

Peace at home, peace in the world.

8. " İle " can be written  seperately as well as attached to the word.

a. When they suffixed to the words that end with a consonant the vowel "i" drops and it follows the vowel harmony ;

bulut-la (bulut ile)

çiçek-le (çiçek ile)

kuş-la (kuş ile)

-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

b. When they suffixed to the words that end with a vowel they take buffer "y" and "i" drops and it follows the vowel harmony.

arkadaşı-y-la (arkadaşı ile)

çevre-y-le (çevre ile)

sürü-y-le (sürü ile)

yapı-y-la (yapı ile)

9. The conjunction "ki" is written seperately.

bilmem ki

demek ki

kaldı ki

------------------------------------------------------------------

* In couple of  exceptions the conjunction "ki" is attached to the word, it is because those words are in fixed  forms.

belki

çünkü

hâlbuki

mademki

meğerki

oysaki

sanki

10. The conjunction "da / de" is written seperately and it follows the vowel harmony.

Kızı da geldi gelini de.

Durumu oğluna da bildirdi.

Sen de mi kardeşim?

Güç de olsa.

Konuşur da konuşur.

* Conjunction "da/de" never changes into "ta/te"

*  "da" that is written with the word "ya"  is seperated.---> Ya  da [Or]

*  Apostrophe can NOT be used  with the conjunction "da/de" .

Ayşe de geldi --> [Ayşe has come too] ---> CORRECT

Ayşe´de geldi ---> [Ayşe has come too] ------> WRONG [because of "apostrophe"]

11. The question suffix " mı / mi / mu / mü "  is written  separately and follows vowel harmony.

Kaldı mı?

Sen de mi geldin?

Olur mu?

İnsanlık öldü mü?

---------------------------------------------------------------------------------------------------

* The suffixes comes after question "mI" is written as attached.

Verecek misin?

Okuyor muyuz?

Çocuk muyum?

Gelecek miydi?

Güler misin ağlar mısın?

----------------------------------------------------------------------------------------------------

Warning ;

In compound words the question suffix " mI"  can come into between two words ;

Vaz mı geçtin?

12. In the end or begining of the new line a single letter can not be left.

                        WRONG. 

.......................................................................................................... u-

çurtma değil.

                      CORRECT

......................................................................................................uçurt-

ma değil.

13. When apostrophe ends in the end of the line we just use apostrophe without dash ;

                         WRONG

.................................................................................................. Edirne’ -

nin...

                              CORRECT

.................................................................................................. Edirne’

nin...