I can´t seem to understand when do you add "se" or "yse" and what does it stand for.. 

It means ´if´.

http://www.turkishclass.com/turkish_lesson_197

and check tunci´s answer here:

http://www.turkishclass.com/forumTitle_59132 

Şimdiki Zaman + Dilek-Şart Kipi = yorsa

Geleck Zaman + Dilek-Şart Kipi = ecekse

miş´li Geçmiş Zaman + Dilek-Şart Kipi = mişse

Dilek-Şart Kipi + miş´li Geçmiş Zaman = seymiş

Dilek-Şart Kipi + di´li Geçmiş Zaman = seydi

di´li Geçmiş Zaman + Dilek-Şart Kipi = diyse

Geniş Zaman + Dilek-Şart Kipi = irse

Gereklik Kipi + Dilek-Şart Kipi = meliyse